Diversité génétique et sélection génomique d’Eucalyptus robusta à Madagascar

Vendredi 26 octobre à 14h, Salle bibliothèque du Fofifa DRFGRN Ambatobe

Intervenant : Tahina RAMBOLARIMANANA, Doctorant en sciences agronomiques et environnementales

Institution, équipe :

  • Ecole Doctorale Gestion des Ressources Naturelles et Développement (ED-GRND), Ecole Supérieure des Sciences Agronomiques d’Antananarivo (ESSA)
  • dP « Forêts Biodiversité » à Madagascar

Domaine de recherche : Amélioration génétique des arbres forestiers

Résumé :

Eucalyptus robusta, introduit depuis un siècle à Madagascar, constitue une ressource importante en bois énergie. Aujourd’hui, plus de 90% de la population utilise le bois pour l’énergie domestique et E. robusta fournit l’essentielle de la production. Cependant, la production est insuffisante à cause de l’explosion de la demande qui suit la croissance démographique. Des mauvaises performances des plantations ont été constatées. Une des raisons évoquées est la dépression par consanguinité due à une base génétique introduite étroite et à des mauvaises pratiques de collecte de graines. Actuellement, il est urgent de créer un programme d’amélioration qui associe la diversité génétique, la performance de production et la qualité des bois.

Cette étude a pour objectif, d’étudier l’origine, la structure et la diversité génétique d’E. robusta à Madagascar, puis de mettre au point la technique de la sélection génomique multi-caractères (GS-MT) pour sélectionner une population d’amélioration. La recherche a été conduite avec 415 individus issus d'un essai de 19 provenances australiennes et 46 individus de provenances malgaches. Près de 3000 marqueurs SNPs ont été utilisés pour les analyses.

Les résultats montrent que les peuplements malgaches sont originaires de Myall Lakes en Australie. Cette origine est très limitée comparée à l'aire naturelle de l'espèce. Une faible diversité génétique a été observée. L'essai de provenances australiennes possède par contre une diversité génétique suffisante pour constituer la population d'amélioration. La GS-MT se révèle très efficace pour la sélection. Un gain génétique en volume de 36% a été obtenu. La GS-MT a permis d’améliorer la diversité génétique et d’associer simultanément les caractères, même si aucune amélioration de la précision de la sélection n’a été constatée à cause des faibles corrélations et héritabilités des caractères. Cette thèse fournit une importante information sur l’application de la génomique pour l’analyse de la diversité et l’amélioration génétique d’une espèce.

Mots clés: Amélioration génétique, Multi-caractères, Génétique des populations, Génétique quantitative, Bois énergie

Equipe d’accueil : Ecologie et biodiversité

Directeurs de thèse: Pr Lolona Ramamonjisoa et Dr hdr Jean-Marc BOUVET